С проекта на Наредба се цели прецизирането и детайлизирането на уредбата в контекста на оптимизирането на процесите по разплащания, верификация, сертификация, приключване на счетоводната година, възстановяване и отписване на неправомерни разходи и осчетоводяване по програмите, както и регулиране на взаимоотношенията между управляващи органи и сертифициращ орган във връзка с тези процеси. Наредбата съдържа и 22 приложения, които в основната си част са формати на стандартизирани документи.В новата наредба ще се регламентира възможността за поетапно покриване на авансовите плащания с допустими разходи от страна на бенефициентите, с което ще се осигури по-доброто финансово изпълнение на проектите и програмите.